Dem CiiM sind derzeit drei Forschungsgruppen des HZI und der MHH direkt zugeordnet und bis zur Inbetriebnahme des neuen Gebäudes im TWINCORE untergebracht. Darüber hinaus sind weitere Professuren der MHH (zum Teil als Gemeinschaftsberufung mit dem HZI) dem CiiM gewidmet. Diese Gruppen sind derzeit in den Räumlichkeiten des HZI und der MHH untergebracht. Weitere Forschungsgruppen der CiiM Fakultät von HZI, MHH und TWINCORE widmen sich in Projekten den Forschungszielen des CiiM. So werden bereits jetzt verschiedene Aspekte des CiiM Workflows erschlossen und das Forschungsfeld etabliert. Gemeinsam tragen die Gruppen somit dazu bei, eine auf den einzelnen Infektionspatienten abgestimmte Behandlung Realität werden zu lassen.