Bioinformatik der Infektionsforschung

Forschungsschwerpunkt

Das primäre Ziel unserer Forschung am CiiM ist die Etablierung datengesteuerter rechnerischer Ansätze, die die individualisierte Infektionsmedizin in der Klinik weiter voranbringen, wie z. B. Methoden, die die relevanten Erreger aus infizierten Patient:innenproben umfassender und schneller identifizieren, als dies mit der heutigen klinischen Routine möglich ist. Zu diesem Zweck arbeiten wir an innovativen Technologien, die sowohl experimentelle als auch computergestützte Analysen mit Hilfe der Hochdurchsatz-Sequenzierung von Patient:innenproben kombinieren. Dieser Ansatz ermöglicht den direkten Nachweis und die Charakterisierung von Krankheitserregern aus komplexen Proben und damit deren schnelle und genaue Identifizierung. Darüber hinaus sind wir daran interessiert, die Wechselwirkungen zwischen Erreger und Wirt zu untersuchen, ihre antimikrobiellen Resistenzen und Virulenzfaktoren zu charakterisieren und die Dynamik mikrobieller Gemeinschaften im Zusammenhang mit der Entwicklung von Infektionskrankheiten zu erforschen.